着丝粒是染色体上非常复杂但又具有特殊功能的区域，尽管功能保守，但相比较基因组其他区域，着丝粒有着更快的进化速率，在不同物种中表现出显著的多样性。由于着丝粒及其周围存在大量重复序列，完整的着丝粒组装一直存在巨大挑战。本氏烟草的基因组于2012年首次测序，近年来虽有多次更新，但基因组仍然存在多个gap，其着丝粒和端粒序列也不完整。 近日，顶级学术期刊《Nature Plants》发表了北京大学现代农业研究院郭立团队题为“The complete genome assembly of Nicotiana benthamiana reveals genetic and epigenetic la
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兰花是被子植物中最大且最为多样化的科之一，石斛属（Dendrobium Sw.）是兰科三大属之一，包含约1800个物种。石斛属物种表现出高度多样化和复杂的形态，由于其观赏和药用价值，石斛在全球范围内引起了公众和研究人员的广泛关注和兴趣，成为许多国家和地区的重要经济植物。 最近，来自新加坡和中国的研究团队合作在著名期刊Nature Plants上面发表了名为《Pangeneric genome analyses reveal the evolution and diversity of the orchid
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完整的遗传变异数据集是生物多样性基因组学研究的关键。长读长测序技术的快速发展，使组装高质量单倍型解析的参考基因组成为可能。然而，即使是单个个体完整的T2T基因组，因为无法充分代表一个种群或物种内的遗传多样性，仍可能会使下游分析产生偏差。通过将来自同一种群、物种或属的多个高质量基因组序列信息整合到单个参考基因组上，这些基因组比对集合组装而成的泛基因组能够克服代表性偏差问题。 近日，来自美国和意大利等多国的科学家团队，在著名期刊Nature Genetics上撰文发表了名为《Pangenome graphs and the
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端粒到端粒（T2T）基因组组装代表了基因组测序和组装领域的一个重要的里程碑，它实现了从染色体的一个端粒到另一个端粒的完整序列的生成。人T2T基因组揭示了以前无法通过测序组装获取的未知区域。T2T基因组也已在重要作物如水稻、大豆和玉米等上获得，为着丝粒功能和进化以及其他基因组特征的研究提供了宝贵见解。 近日，来自默多克大学等地的研究团队在著名期刊Nature Genetics上发表了综述文章Unlocking plant genetics with telomere-to-telomere genome assemblies，在这篇综述中，研究人员讨论了复杂作物T2T基因组面临的挑战，如重
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