小麦（Triticum aestivum）是全球最重要的粮食作物之一，在12个主要生态环境中广泛种植，2021/22年度全球产量达7.78亿吨。气候变化、政治不稳定及耕地减少对小麦生产带来巨大挑战。作为异源六倍体作物，小麦基因组复杂、体积庞大（约15 Gb），包含大量重复序列。近年来，随着测序技术的发展，全球科学家已完成九个高质量小麦基因组的组装，揭示了基因结构重排、野生种基因渗入及国际育种计划的影响。对这些基因组的De novo注释和泛基因组构建为解析小麦的基因多样性、进化历史及表达调控提供了关键基础，为提高产量、品质和抗逆性奠定了重要的分子生物学依据。 国外研究团队于2025年10月
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人类参考基因组是基因组学和生物医学研究的重要基础，但当前版本（包括HPRC的47例双倍体组装及T2T的CHM13单倍体基因组）仍未能充分反映全球人群的遗传多样性，导致对某些群体的基因变异分析存在偏差。虽然中国、非洲等地已开展了泛基因组研究，但在中东地区，尤其是阿拉伯半岛人群的基因组特征仍缺乏深入研究。这些人群具有独特的遗传背景、较高的近亲婚配比例以及复杂的历史迁徙过程，这使得现有参考基因组难以准确描述他们的遗传结构。 哈利法大学的Habiba Alsafar研究员及其科研团队近日发表一篇题目为“The Emirati T2T-Level Pangenome: A Graph of 58
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茄子 (Solanum melongena L.) 隶属于Solanum属（茄科），在全球茄科作物的产量中排名第三。尽管到2024年为止已经发表了四个栽培茄子基因组和两个野生茄子基因组，但仍存在如端粒和着丝粒这样大量缺口和未组装的复杂区域。填补这些空白，为基因挖掘和功能研究、标记辅助育种以及进化生物学提供更多连续完整的茄子基因组序列至关重要。 浙江省农科院蔬菜研究所包崇来研究团队在国际著名期刊Plant Communications上发表名为“A complete telomere-to-telomere genome assembly of Solanum melongena unco
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在非模式生物中，遗传变异的准确刻画对理解种群的进化动力学以及为具有保护意义物种制定管理策略至关重要。然而，这些推断的可靠性在很大程度上依赖于所使用的参考基因组，当引入近缘或外缘物种时容易出现参考偏差（reference bias）：即与参考序列高度相似的测序读段更容易被高质量比对并保留，而差异更大的读段可能比对失败或被剔除，从而导致变异漏检、杂合位点误判甚至偏向参考等问题。 南加州大学Jazlyn A. Mooney教授及研究团队于2025年9月22日在国际著名期刊Cell上发表题为“Reference genome choice compromises population g
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