叉枝蝇子草（Silene latifolia，石竹科）为雌雄异株植物，因其具有一个巨大的Y染色体（大小约550M）而备受关注。 近期国际顶级期刊《Science》背靠背发表了两篇研究叉枝蝇子草Y染色体的研究进展，本期我们将介绍其中一篇相关研究，论文标题为“The Silene latifolia genome and its giant Y chromosome”。作者组装了染色体级别的叉枝蝇子草基因组序列。同时利用近缘非雌雄异株Silene物种的高质量基因组作为外类群，推演了叉枝蝇子草性染色体的演化历程。并最终鉴定了候选性别决定基因。
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紫花苜蓿（Medicago sativa L.）作为一种全球重要的饲草作物，具有品质优异、产量高、生物固氮及抗逆性强的独特优势。苜蓿遗传多样性丰富，即使在多种环境胁迫下仍能保持相对稳定的生长。此外，它与根瘤菌形成共生关系，能有效减少生长期对氮肥的依赖。因此，苜蓿在全球粮食供应和土壤修复中发挥着关键作用。 2025年4月23日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所杨青川团队和中国农业科学院深圳农业基因组研究所张兴坦团队合作，在国际顶级期刊《Nature Genetics》以“Pan-genomic analysis highlights genes associated with
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泛基因组（Pan-genome）代表一个物种的全部遗传信息，包括核心基因（core genome）和非核心基因（dispensable / variable / accessory genome）。其中，核心基因为所有样本种都存在的基因，控制着生命体基本生物学功能和主要的表型特征；非核心基因为仅在单个样本或一部分样本中存在的基因，一般与物种对特定环境的适应性或特有的生物学特征相关，反映了物种的特性。 泛基因组逐渐取代单一参考基因组，将会成为研究动植物进化、选择与基因功能的“新标准”。本期我们整理了今年5月份前，在Nature和Nature Genetics顶刊发表
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华命生物目前已成功完成50+物种的T2T基因组组装，物种涵盖动物、植物、昆虫及同源和异源多倍体等疑难物种，已有多个合作项目在顶级期刊发表和接收，欢迎有需要的老师垂询。联系方式：18371456025。 端粒到端粒（T2T）组装是基因组从头组装的终极目标。现有能够实现接近T2T组装的算法均依赖ONT超长（UL）数据，但ONT UL数据成本高昂且实验制备难度大，因此对于缺乏稳定细胞系的样本通常难以获取。 为了解决以上问题，耶鲁大学医学院的李恒老师近日推出hifiasm（ONT），并于2025年4月14日在预印版平台bioRxiv上线“Efficient near telom
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